| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
|
Data corrente: |
24/10/2014 |
|
Data da última atualização: |
16/11/2022 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
SOMAVILLA, A. L.; SONSTEGARD, T. S.; HIGA, R. H.; ROSA, A. do N.; SIQUEIRA, F.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; COUTINHO, L. L.; MUDADU, M. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. |
|
Afiliação: |
A. L. SOMAVILLA, Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento Animal, UNESP/FCAV, Jaboticabal, Brasil; T. S. SONSTEGARD, Bovine Functional Genomics Laboratory, ANRI, USDA-ARS, Beltsville, MD, USA; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; ANTONIO DO NASCIMENTO ROSA, CNPGC; FABIANE SIQUEIRA, CNPGC; LUIZ OTAVIO CAMPOS DA SILVA, CNPGC; ROBERTO AUGUSTO DE A TORRES JUNIOR, CNPGC; L. L. COUTINHO, Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (Esalq), USP, Piracicaba, Brasil; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CPPSE; MAURICIO MELLO DE ALENCAR, CPPSE; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
|
Título: |
A genome-wide scan for selection signatures in Nellore cattle. |
|
Ano de publicação: |
2014 |
|
Fonte/Imprenta: |
Animal Genetics, v. 45, n. 6, p. 771-781, dec. 2014 |
|
DOI: |
10.1111/age.12210 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Brazilian Nellore cattle (Bos indicus) have been selected for growth traits for over more than four decades. In recent years, reproductive and meat quality traits have become more important because of increasing consumption, exports and consumer demand. The identification of genome regions altered by artificial selection can potentially permit a better understanding of the biology of specific phenotypes that are useful for the development of tools designed to increase selection efficiency. Therefore, the aims of this study were to detect evidence of recent selection signatures in Nellore cattle using extended haplotype homozygosity methodology and BovineHD marker genotypes (>777 000 single nucleotide polymorphisms) as well as to identify corresponding genes underlying these signals. Thirty-one significant regions (P < 0.0001) of possible recent selection signatures were detected, and 19 of these overlapped quantitative trait loci related to reproductive traits, growth, feed efficiency, meat quality, fatty acid profiles and immunity. In addition, 545 genes were identified in regions harboring selection signatures. Within this group, 58 genes were associated with growth, muscle and adipose tissue metabolism, reproductive traits or the immune system. Using relative extended haplotype homozygosity to analyze high-density single nucleotide polymorphism marker data allowed for the identification of regions potentially under artificial selection pressure in the Nellore genome, which might be used to better understand autozygosity and the effects of selection on the Nellore genome. MenosBrazilian Nellore cattle (Bos indicus) have been selected for growth traits for over more than four decades. In recent years, reproductive and meat quality traits have become more important because of increasing consumption, exports and consumer demand. The identification of genome regions altered by artificial selection can potentially permit a better understanding of the biology of specific phenotypes that are useful for the development of tools designed to increase selection efficiency. Therefore, the aims of this study were to detect evidence of recent selection signatures in Nellore cattle using extended haplotype homozygosity methodology and BovineHD marker genotypes (>777 000 single nucleotide polymorphisms) as well as to identify corresponding genes underlying these signals. Thirty-one significant regions (P < 0.0001) of possible recent selection signatures were detected, and 19 of these overlapped quantitative trait loci related to reproductive traits, growth, feed efficiency, meat quality, fatty acid profiles and immunity. In addition, 545 genes were identified in regions harboring selection signatures. Within this group, 58 genes were associated with growth, muscle and adipose tissue metabolism, reproductive traits or the immune system. Using relative extended haplotype homozygosity to analyze high-density single nucleotide polymorphism marker data allowed for the identification of regions potentially under artificial selection pressure in the Nellore genome, whic... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Desequilíbrio de ligação; Homozigose do haplótipo estendido; Polimorfismo de nucleotídeo único; Relative extended haplotype homozygosity; Single nucleotid; Single nucleotide polymorphisms. |
|
Thesagro: |
Bos Indicus; Gado de corte. |
|
Thesaurus Nal: |
Beef cattle; Genotyping; Linkage disequilibrium; Single nucleotide polymorphism. |
|
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético
S Ciências Biológicas |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/110576/1/PROCI-2014.00083-2.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02827naa a2200397 a 4500
001 1998406
005 2022-11-16
008 2014 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1111/age.12210$2DOI
100 1 $aSOMAVILLA, A. L.
245 $aA genome-wide scan for selection signatures in Nellore cattle.$h[electronic resource]
260 $c2014
520 $aBrazilian Nellore cattle (Bos indicus) have been selected for growth traits for over more than four decades. In recent years, reproductive and meat quality traits have become more important because of increasing consumption, exports and consumer demand. The identification of genome regions altered by artificial selection can potentially permit a better understanding of the biology of specific phenotypes that are useful for the development of tools designed to increase selection efficiency. Therefore, the aims of this study were to detect evidence of recent selection signatures in Nellore cattle using extended haplotype homozygosity methodology and BovineHD marker genotypes (>777 000 single nucleotide polymorphisms) as well as to identify corresponding genes underlying these signals. Thirty-one significant regions (P < 0.0001) of possible recent selection signatures were detected, and 19 of these overlapped quantitative trait loci related to reproductive traits, growth, feed efficiency, meat quality, fatty acid profiles and immunity. In addition, 545 genes were identified in regions harboring selection signatures. Within this group, 58 genes were associated with growth, muscle and adipose tissue metabolism, reproductive traits or the immune system. Using relative extended haplotype homozygosity to analyze high-density single nucleotide polymorphism marker data allowed for the identification of regions potentially under artificial selection pressure in the Nellore genome, which might be used to better understand autozygosity and the effects of selection on the Nellore genome.
650 $aBeef cattle
650 $aGenotyping
650 $aLinkage disequilibrium
650 $aSingle nucleotide polymorphism
650 $aBos Indicus
650 $aGado de corte
653 $aDesequilíbrio de ligação
653 $aHomozigose do haplótipo estendido
653 $aPolimorfismo de nucleotídeo único
653 $aRelative extended haplotype homozygosity
653 $aSingle nucleotid
653 $aSingle nucleotide polymorphisms
700 1 $aSONSTEGARD, T. S.
700 1 $aHIGA, R. H.
700 1 $aROSA, A. do N.
700 1 $aSIQUEIRA, F.
700 1 $aSILVA, L. O. C. da
700 1 $aTORRES JUNIOR, R. A. de A.
700 1 $aCOUTINHO, L. L.
700 1 $aMUDADU, M. de A.
700 1 $aALENCAR, M. M. de
700 1 $aREGITANO, L. C. de A.
773 $tAnimal Genetics$gv. 45, n. 6, p. 771-781, dec. 2014
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 113 | |
| 81. |  | IGUMA, L. T.; SOUSA, R. V.; MELO, E. O.; CAMPOS, H. C. F.; FRANCO, M. M; DODE, M. A. N.; RECH, E. L.; RUMPF, R. Desenvolvimento de embriões clones a partir de fibroblastos de bovino adulto transfectados ou não. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 8., 2003, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2003. p. 152.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
|    |
| 82. | | ABUD, S.; SOUZA, P. I. M. de; MOREIRA, C. T.; ANDRADE, S. R. M.; ULBRICH, A. V.; VIANNA, G. R.; RECH, E. L.; ARAGÃO, F. J. L. Dispersão de pólen em soja transgênica na região do Cerrado. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v.38, n. 10, p.1229-1235, out. 2003. NOTAS CIENTÍFICAS| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 84. | | ABUD, S.; SOUZA, P. I. M.; MOREIRA, C. T.; VIANNA, G. R.; ANDRADE, S. R. M.; RECH, E. L.; ARAGAO, F. J. L. Distancia do fluxo genico ocorrido entre a cultivar de soja BR-16 transgenica e a BR-16 nao transgenica no cerrado no Distrito Federal. In: REUNIAO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIAO CENTRAL DO BRASIL, 24., 2002, São Pedro, SP. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2002. p. 205-206.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 85. | | JUNGMANN, L.; ALBINO, M. M. C.; DIAS, B. B. A.; VIANNA, G. R.; RECH, E. L.; FARIA, J. C. de; ARAGÃO, F. J. L. Desenvolvimento de sistema para obtenção de plantas de feijão resistentes ao vírus do mosaico dourado do feijoeiro. In: REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 6., 1999, Salvador : Resumos expandidos. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 1999. v.1. p. 42-43. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 99).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 86. | | JUNGMANN, L. C.; ALBINO, M. M. C.; DIAS, B. B. A.; VIANNA, G. R.; RECH, E. L.; FARIA, J. C.; ARAGÃO, F. J. L. Desenvolvimento de sistema para obtenção de plantas de feijão resistentes ao vírus do mosaico dourado do feijoeiro. In: WORKSHOP DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 4., 1999, Brasília. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: EMBRAPA-CENARGEN, 1999. p. 48.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 87. | | ARAGÃO, F. J. L.; BARROS, L. M. G.; BRASILEIRO, A. C. M.; RIBEIRO, S. G.; SMITH, F. D.; SANFORD, J. C.; FARIA, J. C.; RECH, E. L. Inheritance of foreign genes in transgenic bean (Phaseolus vulgaris L.) co-transformed via particle bombardment. Theoretical and Applied Genetics, Berlin, v.93, n.l/2, p.142-150, l996. p. 142-150| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
|  |
| 88. | | ARAGAO, F. J. L.; BARROS, L. M. G.; BRASILEIRO, A. C. M.; RIBEIRO, S. G.; FARIA, J. C.; RECH, E. L. Stable co-transformation of bean (Phaseolus vulgaris) via particle bombardment. Revista Brasileira de Genetica, Ribeirao Preto, v.l8, n.3, p.246, 1995. Suplemento. p.246 Resumo.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 89. | | CUNHA, N. B.; JUNGMANN, L.; CIPRIANO, T. M.; PÓVOA, A. M.; de LUCCA, P. C.; LEITE, A. VIANNA, G. R.; ARAGÃO. F. J. L.; RECH, E. L. Transformação genética de plantas de soja [Glycine max L.(MERRIL)] visando a produção do anticorpo scfvdir83d4, anti-antígeno tumoral TN. ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENETICOS E BIOTECNOLOGIA, 8., 2003, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2003. p. 52| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 90. | | VIANNA, G. R.; IRALA, L. H.; SANTOS, C. R.; RAMA SWAMI, N.; BONFIM, K.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; ARAGÃO, F. J. L.; RECH, E. L. Transformação genética de tabaco visando obter plantas mais tolerantes a estresses abióticos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: Sociedade Brasileira de Genética, 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 91. | | ARAGAO, F. J. L.; RIBEIRO, S. G.; BRASILEIRO, A. C. M.; BARROS, L. M. G.; RECH, E. L.; FARIA, J. C. Transformation of bean for resistance to bean golden mosaic virus. In: ENCUENTRO LATINO AMERICANO DE BIOTECNOLOGIA VEGETAL, 2., 1995, Puerto Iguazu, Argentina. REDBIO95. [S.l.:s.n.], 1995. n.B-1.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 92. | | ARAGÃO, F. J. L.; BARROS, L. M. G.; BRASILEIRO, A. C. M.; ALMEIDA, E. R. SA, M. F. G. de; GANDER, E. S.; RECH, E. L. Transgenic bean plants expressing a methionine-rich albumin gene and progeny analysis. In: ENCUENTRO LATINOAMERICANO DE BIOTECNOLOGIA VEGETAL, 2., 1995, Puerto Iguazu, Argentina. REDBIO95. [S.l:s.n.], l995. n. A-5.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 93. | | ARAGÃO, F. J. L.; RIBEIRO, S. G.; BARROS, L. M. G.; BRASILEIRO, A. C. M.; MAXWELL, D. P.; RECH, E. L.; FARIA, J. C. Transgenic beans (Phaseolus vulgaris L.) engineered to express viral antisense RNAs show delayed and attenuated symptoms to bean golden mosaic geminivirus. Molecular Breeding, v. 4, n. 6, p. 491-499, Dec. 1998.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 95. | | NUNES, A. C. S.; VIANNA, G. R.; CUNEO, F.; AMAYA-FARFÁN, J.; CAPDEVILLE, G. de; RECH, E. L.; ARAGÃO, F. J. L. RNAi-mediated silencing of the myo-inositol-1-phosphate synthase gene (GmMIPS1) in transgenic soybean inhibited seed development and reduced phytate content. Planta, v. 224, p. 125-132, 2006.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: -- - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 97. | | TINOCO, M. L. P.; REIS, M. B. A.; ABUD, S.; SOUZA, P. I. M.; VIANNA, G. R.; RECH, E. L.; ARAGÃO, F. J. L. Uso de radiação gama na eliminação de genes marcadores de soja geneticamente modificada. ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENETICOS E BIOTECNOLOGIA, 8., 2003, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2003. p. 54| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 98. | | SILVA JUNIOR, O. B.; SÁ, M. E. L.; PESSOA-FILHO, M.; MELO, C. L. P. de; ARIAS, C. A. A.; GRATTAPAGLIA, D.; RECH, E. L. Reference grade genome sequence assembly for a Brazilian soybean germplasm. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 10., 2019, Águas de Lindóia. Tema: Pesquisa e Inovação para o Desenvolvimento da Sociedade: resumos dos trabalhos. [S.l.]: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2019. p. 64| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 99. | | SILVA JUNIOR, O. B.; SÁ, M. E. L.; PESSOA-FILHO, M.; MELO, C. L. P. de; ARIAS, C. A. A.; GRATTAPAGLIA, D.; RECH, E. L. Reference grade genome sequence assembly for a Brazilian soybean germplasm. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 10., 2019, Águas de Lindóia. Tema: Pesquisa e Inovação para o Desenvolvimento da Sociedade: resumos dos trabalhos. [S.l.]: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2019. p. 64| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 100. | | O'KEEFE, B. R.; MURAD, A. M.; VIANNA, G. R.; RAMESSAR, K.; SAUCEDO, C. J.; WILSON, J.; BUCKHEIT, K. W.; CUNHA, N. B. da; ARAUJO, A. C. G.; LACORTE, C. C.; MADEIRA, L.; MCMAHON, J. B.; RECH, E. L. Engineering soya bean seeds as a scalable platform to produce cyanovirin-N, a non-ARV microbicide against HIV. Plant Biotechnology Journal, p. 1-9, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| Registros recuperados : 113 | |
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
